| 2020 | Best Paper Award | Jan Derbisz, Tomasz Krawczyk | Pokaż |
| 2016 | Nagroda Złotej Róży za najlepsza książkę popularnonaukową polskiego autora | Krzysztof Ciesielski, Zdzisław Pogoda | Pokaż |
| 2020 | Nagroda Ministra Nauki i Szkolnictwa Wyższego za znaczące osiągnięcia w zakresie działalności organizacyjnej | Klaudiusz Wójcik | Pokaż |
| 2021 | Nagroda im. Edyty Szymańskiej III edycja | Anna Szymusiak | Pokaż |
| 2020 | Program stypendialny im. M. Bekkera | Piotr Kalita | Pokaż |
| 2021 | Program stypendialny im. M. Bekkera | Marcin Kozik | Pokaż |
| 1999 | Nagroda im. Profesora Hugona Steinhausa | Krzysztof Ciesielski, Zdzisław Pogoda | Pokaż |
| 2022 | ACADEMIA 2016 | Adam Roman | Pokaż |
| 1994 | Nagroda Ministra Edukacji Narodowej | Marek Jarnicki | Pokaż |
| 2024 | Program stypendialny im. M. Bekkera | Robert Szczelina | Pokaż |
| 2011 | Nagroda Prezesa Rady Ministrów | Marcin Kozik | Pokaż |
| 2021 | Nagroda im. Otto Wichterle | Tomasz Kania | Pokaż |
| 2001 | Baskerville Fellowship 2001 | Marcin Kulczycki | Pokaż |
| 2009 | Stypendium dla młodych naukowców „Zostańcie z nami!” | Maciej Ulas | Pokaż |
| 2010 | Stypendium dla młodych naukowców „Zostańcie z nami!” | Maciej Ulas | Pokaż |
| 1996 | Nagroda im. Tadeusza Ważewskiego | Roman Srzednicki | Pokaż |
| 2001 | Nagroda Ministra Edukacji Narodowej | Roman Srzednicki | Pokaż |
| 2016 | Best European Invention Award | Michał Markiewicz | Pokaż |
| 2021 | Nagroda Miasta Krakowa | Jarosław Duda | Pokaż |
| 2016 | Nagroda Główna Polskiego Towarzystwa Matematycznego im. Hugona Steinhausa | Piotr Zgliczyński | Pokaż |
| 2015 | Stypendium Ministra Nauki i Szkolnictwa Wyższego dla wybitnych młodych naukowców | Michał Kapustka | Pokaż |
| 2014 | Stypendium Ministra Nauki i Szkolnictwa Wyższego dla wybitnych młodych naukowców | Maciej Ulas | Pokaż |
| 2016 | Stypendium Ministra Nauki i Szkolnictwa Wyższego dla wybitnych młodych naukowców | Łukasz Kosiński | Pokaż |
| 2016 | Stypendium Ministra Nauki i Szkolnictwa Wyższego dla wybitnych młodych naukowców | Bartosz Walczak | Pokaż |
| 2014 | Nagroda im. Stefana Bergmana | Sławomir Kołodziej | Pokaż |
| 2014 | Nagroda Ministra Edukacji i Nauki za całokształt dorobku naukowego | Franciszek Hugon Szafraniec | Pokaż |
| 2018 | Nagroda Prezesa Rady Ministrów | Wojciech Kucharz | Pokaż |
