| 1978 | Nagroda Ministra Nauki, Szkolnictwa Wyższego i Techniki III stopnia | Marek Jarnicki | Pokaż |
| 1979 | Nagroda Polskiego Towarzystwa Matematycznego dla młodych matematyków | Marek Jarnicki | Pokaż |
| 1987 | Nagroda Ministra Edukacji Narodowej III stopnia | Krzysztof Ciesielski | Pokaż |
| 1988 | Nagroda Sekretarza Naukowego Polskiej Akademii Nauk | Marek Jarnicki | Pokaż |
| 1994 | Nagroda Ministra Edukacji Narodowej | Marek Jarnicki | Pokaż |
| 1995 | Nagroda główna Polskiego Towarzystwa Matematycznego im. Samuela Dicksteina | Krzysztof Ciesielski, Zdzisław Pogoda | Pokaż |
| 1995 | II Nagroda w Konkursie Uniwersytetu Warszawskiego na pytanie egzaminacyjne | Krzysztof Ciesielski | Pokaż |
| 1995 | I Nagroda w Konkursie Towarzystwa Asystentów UJ na najlepszą pracę naukową | Krzysztof Ciesielski | Pokaż |
| 1996 | Nagroda im. Tadeusza Ważewskiego | Roman Srzednicki | Pokaż |
| 1999 | Nagroda im. Profesora Hugona Steinhausa | Krzysztof Ciesielski, Zdzisław Pogoda | Pokaż |
| 2000 | Nagroda Prezesa Rady Ministrów | Sławomir Rams | Pokaż |
| 2001 | Baskerville Fellowship 2001 | Marcin Kulczycki | Pokaż |
| 2001 | Dean's Graduate Student Research Award 2001 | Marcin Kulczycki | Pokaż |
| 2001 | Nagroda Ministra Edukacji Narodowej | Marek Jarnicki | Pokaż |
| 2001 | Nagroda Ministra Edukacji Narodowej | Roman Srzednicki | Pokaż |
| 2003 | Nagroda indywidualna Ministra Edukacji Narodowej i Sportu | Sławomir Rams | Pokaż |
| 2003 | Stypendium START 2003 | Sławomir Rams | Pokaż |
| 2003 | Nagroda Rektora "Laur Jagielloński" | Józef Siciak | Pokaż |
| 2003 | Medal Komisji Edukacji Narodowej | Jerzy Szczepański | Pokaż |
| 2005 | Nagroda Prezesa Rady Ministrów za wyróżniającą się rozprawę doktorską | Tomasz Kapela | Pokaż |
| 2005 | Nagroda Rektora "Laur Jagielloński" | Franciszek Hugon Szafraniec | Pokaż |
| 2006 | Nagroda Rektora UJ im. Hugona Kołłątaja | Krzysztof Ciesielski, Zdzisław Pogoda | Pokaż |
| 2006 | Nagroda Pro Arte Docendi | Jerzy Ombach | Pokaż |
| 2007 | Nagroda Rektora UJ im. Hugona Kołłątaja | Edward Tutaj | Pokaż |
| 2009 | Stypendium dla młodych naukowców „Zostańcie z nami!” | Maciej Ulas | Pokaż |
| 2009 | Nagroda Rektora UJ im. Hugona Kołłątaja | Jerzy Szczepański | Pokaż |
| 2010 | Stypendium START 2010 | Maciej Ulas | Pokaż |
